Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRTO14522 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRTO14522 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PTPRTO14522 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PTPRTO14522 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PTPRTO14522 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
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