Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SNAP23O00161 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNAP23O00161 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SNAP23O00161 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNAP23O00161 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms