Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC01387J3KSC0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC01387J3KSC0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC01387J3KSC0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LINC01387J3KSC0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms