Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BNC9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BNC9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
H3BNC9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
H3BNC9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
H3BNC9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
H3BNC9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BNC9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BNC9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BNC9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BNC9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BNC9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BNC9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H3BNC9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BNC9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BNC9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
H3BNC9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BNC9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BNC9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BNC9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BNC9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BNC9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BNC9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BNC9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BNC9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H3BNC9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BNC9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BNC9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
H3BNC9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
H3BNC9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H3BNC9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
H3BNC9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H3BNC9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
H3BNC9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
H3BNC9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H3BNC9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H3BNC9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
H3BNC9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H3BNC9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H3BNC9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
H3BNC9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
H3BNC9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H3BNC9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BNC9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BNC9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BNC9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BNC9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BNC9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BNC9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BNC9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BNC9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H3BNC9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
H3BNC9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
H3BNC9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
H3BNC9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H3BNC9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H3BNC9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H3BNC9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
H3BNC9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
H3BNC9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BNC9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BNC9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BNC9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BNC9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BNC9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BNC9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H3BNC9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BNC9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BNC9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BNC9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
H3BNC9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BNC9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BNC9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BNC9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BNC9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BNC9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H3BNC9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H3BNC9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H3BNC9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H3BNC9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H3BNC9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
H3BNC9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
H3BNC9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H3BNC9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
H3BNC9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H3BNC9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
H3BNC9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
H3BNC9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BNC9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BNC9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BNC9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BNC9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BNC9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BNC9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
H3BNC9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BNC9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BNC9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
H3BNC9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BNC9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
H3BNC9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms