Protein–RNA interactions for Protein: H3BMM0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMM0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BMM0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BMM0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BMM0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BMM0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BMM0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BMM0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BMM0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BMM0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BMM0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BMM0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H3BMM0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BMM0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BMM0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BMM0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BMM0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BMM0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H3BMM0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BMM0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BMM0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BMM0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BMM0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BMM0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BMM0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H3BMM0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3BMM0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3BMM0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3BMM0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3BMM0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3BMM0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3BMM0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H3BMM0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
H3BMM0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BMM0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BMM0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BMM0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BMM0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BMM0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BMM0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BMM0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BMM0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BMM0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BMM0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H3BMM0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3BMM0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3BMM0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H3BMM0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3BMM0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3BMM0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3BMM0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3BMM0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3BMM0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H3BMM0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3BMM0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3BMM0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3BMM0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H3BMM0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BMM0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BMM0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BMM0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BMM0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BMM0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H3BMM0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BMM0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BMM0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BMM0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BMM0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BMM0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BMM0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H3BMM0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BMM0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BMM0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BMM0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H3BMM0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
H3BMM0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
H3BMM0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BMM0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BMM0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BMM0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BMM0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BMM0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BMM0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BMM0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H3BMM0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3BMM0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3BMM0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3BMM0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3BMM0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3BMM0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3BMM0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3BMM0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3BMM0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3BMM0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3BMM0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3BMM0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3BMM0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H3BMM0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BMM0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BMM0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H3BMM0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms