Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEDD8-MDP1E9PL57 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEDD8-MDP1E9PL57 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEDD8-MDP1E9PL57 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEDD8-MDP1E9PL57 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms