Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4E1Z4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4E1Z4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4E1Z4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4E1Z4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
B4E1Z4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
B4E1Z4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
B4E1Z4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
B4E1Z4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
B4E1Z4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
B4E1Z4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
B4E1Z4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
B4E1Z4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
B4E1Z4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
B4E1Z4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
B4E1Z4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
B4E1Z4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
B4E1Z4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
B4E1Z4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
B4E1Z4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
B4E1Z4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
B4E1Z4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4E1Z4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4E1Z4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4E1Z4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4E1Z4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4E1Z4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
B4E1Z4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
B4E1Z4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29■■■□□ 2.23
B4E1Z4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
B4E1Z4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
B4E1Z4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
B4E1Z4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
B4E1Z4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
B4E1Z4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
B4E1Z4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
B4E1Z4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
B4E1Z4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
B4E1Z4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
B4E1Z4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
B4E1Z4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
B4E1Z4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
B4E1Z4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
B4E1Z4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
B4E1Z4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
B4E1Z4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
B4E1Z4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
B4E1Z4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
B4E1Z4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
B4E1Z4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
B4E1Z4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
B4E1Z4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
B4E1Z4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
B4E1Z4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
B4E1Z4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
B4E1Z4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
B4E1Z4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
B4E1Z4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
B4E1Z4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
B4E1Z4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
B4E1Z4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
B4E1Z4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
B4E1Z4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
B4E1Z4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
B4E1Z4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4E1Z4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4E1Z4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4E1Z4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4E1Z4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4E1Z4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4E1Z4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4E1Z4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4E1Z4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4E1Z4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
B4E1Z4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4E1Z4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4E1Z4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4E1Z4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4E1Z4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4E1Z4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4E1Z4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4E1Z4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4E1Z4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
B4E1Z4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4E1Z4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4E1Z4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4E1Z4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4E1Z4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4E1Z4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4E1Z4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4E1Z4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4E1Z4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4E1Z4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4E1Z4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4E1Z4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
B4E1Z4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
B4E1Z4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
B4E1Z4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
B4E1Z4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
B4E1Z4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms