Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VGLL3A8MV65 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VGLL3A8MV65 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VGLL3A8MV65 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VGLL3A8MV65 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms