Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA8A3KMH1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
VWA8A3KMH1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VWA8A3KMH1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VWA8A3KMH1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VWA8A3KMH1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms