Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C19orf12Q9NSK7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms