Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX1P78337 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX1P78337 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX1P78337 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX1P78337 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX1P78337 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX1P78337 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX1P78337 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX1P78337 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX1P78337 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX1P78337 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX1P78337 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX1P78337 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PITX1P78337 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PITX1P78337 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PITX1P78337 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms