Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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