Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRKQ15262 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
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