Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC4A4Q9Y6R1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms