Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CBX2Q14781 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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