Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CALD1Q05682 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CALD1Q05682 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms