Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARF3P61204 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARF3P61204 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARF3P61204 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARF3P61204 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms