Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PATL2C9JE40 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PATL2C9JE40 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PATL2C9JE40 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PATL2C9JE40 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PATL2C9JE40 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PATL2C9JE40 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PATL2C9JE40 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PATL2C9JE40 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PATL2C9JE40 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PATL2C9JE40 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PATL2C9JE40 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms