Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN2Q9UHD9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN2Q9UHD9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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