Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
THBS4P35443 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
THBS4P35443 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
THBS4P35443 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
THBS4P35443 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
THBS4P35443 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
THBS4P35443 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
THBS4P35443 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
THBS4P35443 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
THBS4P35443 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
THBS4P35443 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
THBS4P35443 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
THBS4P35443 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
THBS4P35443 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
THBS4P35443 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
THBS4P35443 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
THBS4P35443 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
THBS4P35443 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
THBS4P35443 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
THBS4P35443 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
THBS4P35443 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
THBS4P35443 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
THBS4P35443 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
THBS4P35443 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
THBS4P35443 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
THBS4P35443 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms