Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZIC3O60481 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZIC3O60481 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms