Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SGCBQ16585 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCBQ16585 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms