Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
FRMPD4Q14CM0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FRMPD4Q14CM0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms