Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 ARL6IP4-219ENST00000542099 1119 ntTSL 326.49■■□□□ 1.831e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 ARL6IP4-209ENST00000442210 716 ntTSL 325.18■■□□□ 1.621e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 ARL6IP4-216ENST00000539770 1295 ntTSL 1 (best)24.48■■□□□ 1.511e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.511e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.381e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.341e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 ARL6IP4-214ENST00000536502 1273 ntTSL 223.17■■□□□ 1.31e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.271e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.193e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.151e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 ARL6IP4-215ENST00000539576 1684 ntTSL 521.13■□□□□ 0.971e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.411e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 ARL6IP4-206ENST00000413381 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.41□□□□□ -0.11e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 MAFK-202ENST00000403150 2773 ntTSL 228.3■■■□□ 2.124e-9■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.127e-8■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.251e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 REPIN1-205ENST00000467980 899 ntTSL 328.86■■■□□ 2.211e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 REPIN1-206ENST00000469309 910 ntTSL 227.75■■■□□ 2.031e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.71e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 REPIN1-215ENST00000495535 672 ntTSL 325.2■■□□□ 1.621e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 REPIN1-219ENST00000522266 480 ntTSL 225.2■■□□□ 1.621e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 REPIN1-213ENST00000488943 1262 ntTSL 523.58■■□□□ 1.371e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 REPIN1-208ENST00000475514 1192 ntTSL 523.31■■□□□ 1.321e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 REPIN1-207ENST00000473391 1064 ntTSL 223.15■■□□□ 1.31e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.991e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.971e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.881e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.531e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.531e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 REPIN1-218ENST00000519397 583 ntTSL 417.85■□□□□ 0.451e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 REPIN1-212ENST00000487455 464 ntTSL 410.93□□□□□ -0.661e-6■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 SON-206ENST00000429093 684 ntTSL 514.18□□□□□ -0.142e-9■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 SON-208ENST00000455528 8394 ntTSL 1 (best)13.88□□□□□ -0.192e-9■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.352e-9■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 SON-207ENST00000436227 5269 ntAPPRIS P1 TSL 59.35□□□□□ -0.912e-9■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 SON-209ENST00000457208 765 ntTSL 38.81□□□□□ -12e-9■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 SON-211ENST00000467616 676 ntTSL 56.15□□□□□ -1.422e-9■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.452e-9■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.239e-9■■■□□ 18.5
GTF2F1P35269 DAZAP1-207ENST00000589484 3414 ntTSL 215.12■□□□□ 0.017e-7■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 WDR34-204ENST00000473486 714 ntTSL 228.64■■■□□ 2.182e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 WDR34-205ENST00000480613 739 ntTSL 325.34■■□□□ 1.652e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 FSCN1-204ENST00000447103 713 ntTSL 421.84■■□□□ 1.093e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.992e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 FSCN1-203ENST00000444748 580 ntTSL 321.18■□□□□ 0.983e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 FSCN1-202ENST00000405801 550 ntTSL 420.83■□□□□ 0.933e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 WDR34-206ENST00000483181 801 ntTSL 216.82■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 SRC-211ENST00000497734 446 ntTSL 1 (best)13.33□□□□□ -0.284e-7■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 HSPA4-201ENST00000304858 4825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.231e-10■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.723e-10■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.143e-10■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CYBA-203ENST00000562209 624 ntTSL 522.09■■□□□ 1.132e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CYBA-202ENST00000561972 464 ntTSL 317.54■□□□□ 0.42e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CYBA-204ENST00000563526 1052 ntTSL 217.35■□□□□ 0.372e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.232e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CYBA-209ENST00000568278 439 ntTSL 514.41□□□□□ -0.12e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 TCF7L2-202ENST00000346198 667 ntTSL 37.48□□□□□ -1.211e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 TAL1-206ENST00000481091 504 ntTSL 317.63■□□□□ 0.419e-8■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.322e-7■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.242e-7■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 C2orf48-202ENST00000619640 480 ntTSL 1 (best)16.49■□□□□ 0.232e-7■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 ARVCF-206ENST00000467828 258 ntTSL 321.34■■□□□ 1.012e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CARHSP1-215ENST00000570125 681 ntTSL 431.23■■■□□ 2.591e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CARHSP1-206ENST00000563815 1913 ntTSL 221.63■■□□□ 1.051e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.971e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.81e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.771e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CARHSP1-204ENST00000562586 578 ntTSL 218■□□□□ 0.471e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.231e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CARHSP1-214ENST00000569572 578 ntTSL 316.19■□□□□ 0.181e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.171e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.091e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CARHSP1-210ENST00000567908 565 ntTSL 215.52■□□□□ 0.081e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 CARHSP1-207ENST00000565287 556 ntTSL 315.22■□□□□ 0.031e-6■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.098e-7■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.018e-7■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.828e-7■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 ATXN1-209ENST00000495178 853 ntTSL 1 (best)4.73□□□□□ -1.652e-17■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 MICALL2-213ENST00000490608 631 ntTSL 216.39■□□□□ 0.212e-7■■■□□ 18.4
GTF2F1P35269 ZMYND8-208ENST00000435836 670 ntTSL 59.45□□□□□ -0.92e-6■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 COLCA2-203ENST00000528846 823 ntTSL 322.18■■□□□ 1.144e-7■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.974e-7■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.874e-7■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 COLCA2-207ENST00000639470 1207 ntTSL 1 (best)18.46■□□□□ 0.554e-7■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.554e-7■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.554e-7■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.014e-7■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.654e-6■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 CSNK1G2-209ENST00000591752 648 ntTSL 518.97■□□□□ 0.634e-6■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.723e-7■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.513e-7■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.483e-7■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.333e-7■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 BCAR1-211ENST00000562556 4659 ntTSL 215.52■□□□□ 0.073e-7■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.133e-7■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 BMP4-208ENST00000559642 505 ntTSL 314.26□□□□□ -0.132e-6■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 BCAR1-210ENST00000561970 594 ntTSL 432.46■■■□□ 2.795e-7■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 KPTN-209ENST00000602193 588 ntTSL 422.7■■□□□ 1.225e-10■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 KPTN-204ENST00000595484 638 ntTSL 320.76■□□□□ 0.915e-10■■■□□ 18.3
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 291.9 ms