Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGF29Q96ES7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms