Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GKAP1Q5VSY0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms