Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MS4A13Q5J8X5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A13Q5J8X5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms