Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF235Q14590 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms