Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms