Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNCBQ16143 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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