Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
TMEM258P61165 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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