Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RHBDL2Q9NX52 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDL2Q9NX52 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms