Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB4Q9NTQ9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms