Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DNAJA4Q8WW22 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms