Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA1P20827 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms