Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHOX2AO14813 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms