Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHRF1Q9P1Y6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms