Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ALFQ53S48 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms