Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP5P45974 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP5P45974 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP5P45974 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms