Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHC1P29353 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SHC1P29353 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHC1P29353 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHC1P29353 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHC1P29353 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHC1P29353 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHC1P29353 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHC1P29353 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SHC1P29353 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SHC1P29353 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SHC1P29353 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHC1P29353 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHC1P29353 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHC1P29353 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms