Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSGALNACT2Q8N6G5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSGALNACT2Q8N6G5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms