Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11FIP3O75154 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms