Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAB1Q9Y478 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKAB1Q9Y478 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAB1Q9Y478 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAB1Q9Y478 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAB1Q9Y478 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms