Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Q9Y3F1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Q9Y3F1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Q9Y3F1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Q9Y3F1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q9Y3F1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms