Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP17Q9ULZ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP17Q9ULZ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP17Q9ULZ9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MMP17Q9ULZ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms