Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGA11Q9UKX5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGA11Q9UKX5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ITGA11Q9UKX5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGA11Q9UKX5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms