Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT2

UBA2, SUMO-activating enzyme subunit 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA2Q9UBT2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBA2Q9UBT2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBA2Q9UBT2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBA2Q9UBT2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBA2Q9UBT2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBA2Q9UBT2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBA2Q9UBT2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBA2Q9UBT2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UBA2Q9UBT2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBA2Q9UBT2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBA2Q9UBT2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UBA2Q9UBT2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBA2Q9UBT2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms