Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ARHGEF12Q9NZN5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ARHGEF12Q9NZN5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ARHGEF12Q9NZN5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ARHGEF12Q9NZN5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
ARHGEF12Q9NZN5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ARHGEF12Q9NZN5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ARHGEF12Q9NZN5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARHGEF12Q9NZN5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
ARHGEF12Q9NZN5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
ARHGEF12Q9NZN5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
ARHGEF12Q9NZN5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms