Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
STRN4Q9NRL3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
STRN4Q9NRL3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
STRN4Q9NRL3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
STRN4Q9NRL3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
STRN4Q9NRL3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
STRN4Q9NRL3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
STRN4Q9NRL3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
STRN4Q9NRL3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRN4Q9NRL3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRN4Q9NRL3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
STRN4Q9NRL3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
STRN4Q9NRL3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
STRN4Q9NRL3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
STRN4Q9NRL3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
STRN4Q9NRL3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
STRN4Q9NRL3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
STRN4Q9NRL3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
STRN4Q9NRL3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
STRN4Q9NRL3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
STRN4Q9NRL3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms