Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
GDF3Q9NR23 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GDF3Q9NR23 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF3Q9NR23 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF3Q9NR23 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms